服務介紹 Service Introduction
隨著高通量測序成本的大幅度降低以及測序效率的大幅度提升,使得目前進行全基因組重測序成為一種用來查找變異的常規(guī)手段,重 測序是對已知基因組的物種的不同個體或同一個體的不同組織進行全基因組測序,通過與參考基因組比較分析,獲得個體基因組的序列信 息,得到與參考基因組的各種變異信息,例如 SNP、InDel、SV 、CNV 等變異信息,對獲得遺傳變異的致病基因、了解群體遺傳學以及 物種的進化過程、進行自然選擇等研究具有重要的意義。
技術流程 Technical Procedures
利用物理方法將基因組 DNA 進行隨機打斷后,根據(jù)建庫所需片段大小進行回收,利用標準的 Illumina 建庫流程構建小片段測序文庫, 采用 150PE 模式進行測序,總體的測序深度在 30×,但根據(jù)不同的實驗測序要求測序深度可以進行調整。
生物信息學分析 Bioinformatics Analysis
樣品要求 Sample Requirements
實驗類型 | DNA樣品總量 | 樣品濃度和純度 | 樣品保存 | 樣品選擇 |
動植物基因組重測序 | ≥1 μg | 樣品濃度 >50 ng/μl,OD260/280 介于 1.8-2.0 之間,無肉眼可見雜質污染,基因組完整、無降解,電泳中 DNA 主帶應大于 23 kb | 請選擇干粉、酒精、TE 或超純水的保存方式 | 對于植物樣品建議選取黑暗培養(yǎng)的黃化苗或嫩苗,動物樣品應選擇肌肉、血等脂肪含量較少的組織進行取樣 |